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En esta región suelen encontrarse las siguientes especies, en vías de extinción: conejo, coyote, gato montés, lince, ardilla, rata de campo, hurón, tuza, zorrillo, tlacuache, cacomiztle, armadillo y murciélagos.

Especies domésticas: ganado bovino, ovino, caprino, asnar, equino, porcino y aves de corral (guajolotes, pollos, gallinas, gallos, patos, gansos y palomos).

Reptiles: culebras, víboras de cascabel, lagartos, lagartijas, escorpiones y camaleones.

En las presas y bordos se encuentran: ranas, acociles, ajolotes, carpas y sapos. Trucha arcoiris únicamente en la presa Brockman.

Existen otras especies menores como: abejas, avispas, jicotes, hormigas rojas y negras, así como algunas variedades de mariposas.

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